En el contexto del T-MEC, el secretariado de la Comisión para la Cooperación Ambiental (CCA) recomendó una investigación del Tren Maya, ya que ciudadanos argumentaron omisiones en la aplicación de la legislación ambiental por “la presunta fragmentación de los estudios de impacto ambiental, la autorización de cambio de uso del suelo y la aplicación del mecanismo de denuncia ciudadana”.